Les espèces patrimoniales regroupent l’ensemble des espèces protégées, des espèces menacées (liste rouge) et des espèces rares, ainsi que (parfois) des espèces ayant un intérêt scientifique ou symbolique.
 - Grand-murin (Myotis myotis), gorges du Doux © Daniel Staub 
 - Murins de Bechstein (Myotis bechsteinii), gorges de la Daronne © Quentin Bellamy 
 - Castor d’Europe (Castor fiber), milieux alluviaux © Guillaume Bacciotti 
 - Empreintes de Loutre d’Europe (Lutra lutra), gorges du Doux © Didier Ariagno 
 - Loutre d’Europe (Lutra lutra) © LPO 
 - Loir gris (Glis glis), gorges du Doux © Daniel Staub 
 - Hérisson d’Europe (Erinaceus europaeus), gorges du Doux © Béatrice Gratessole 
 - Hibou Grand-duc (Bubo bubo), gorges du Doux © Jean-Luc Lavigne 
 - Circaète Jean-le-Blanc (Circaetus gallicus), gorges du Doux © Ladeno 
 - Milan royal (Milvus milvus) marqué, gorges du Doux © Pascal Desmet 
 - Martin pêcheur d’Europe (Alcedo atthis) © Clément Chauvet 
 - Guêpier d’Europe (Merops apiaster), Pierre-Aiguille © David Leduc 
 - Ecrevisse à pieds blancs (Austropotamobius pallipes), étang du Mouchet © Claude Sanitas 
 - Salamandre tachetée (Salamandra salamandra), gorges du Doux © Entente Doux Mialan 
 - Grenouille agile (Rana dalmatina), gorges de la Daronne © Sophie Forot 
 - Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata), affluent rive droite du Rhône © Sophie Forot 
 - Lézard ocellé (Timon lepidus), massif de Pierre-Aiguille © Sophie Forot 
 - Lézard à deux raies (Lacerta bilineata), gorges du Doux © Quentin Bellamy 
 - Couleuvre vipérine (Natrix maura), gorges du Doux © Daniel Staub 
 - Couleuvre verte et jaune adulte, vallée de l’Herbasse © Jean-Jacques Bertin 
 - Vipère aspic (Vipera aspis), gorges du Doux © Danie Mailfer 
 - Agrion de Mercure (Coenagrion mercuriale), marais des Ulèzes © Sophie Forot 
 - Aeschne paisible ♀ (Boyera irene) en ponte, gorges du Doux © Benoît Delhome 
 - Azuré des orpins (Scolitantides orion), gorges de la Daronne © Sébastien Darnaud 
 - Damier de la succise (Euphydryas aurinia), gorges du Duzon © Sophie Forot